Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf8Q6DID3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms