Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TroQ6DIC6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms