Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ltn1Q6A009 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms