Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msl2Q69ZF8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms