Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms