Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf280dQ68FE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf280dQ68FE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms