Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CltcQ68FD5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms