Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Papd5Q68ED3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Papd5Q68ED3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Papd5Q68ED3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms