Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Top2bQ64511 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms