Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms