Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup62Q63850 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms