Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vat1Q62465 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms