Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha6Q62413 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epha6Q62413 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms