Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tff3Q62395 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff3Q62395 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms