Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SnrpaQ62189 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms