Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PtprrQ62132 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprrQ62132 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms