Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Prm3Q62100 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms