Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2aQ62066 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms