Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms