Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsx2Q61412 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vsx2Q61412 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms