Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinQ61043 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NinQ61043 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinQ61043 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinQ61043 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinQ61043 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinQ61043 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinQ61043 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinQ61043 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinQ61043 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinQ61043 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinQ61043 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinQ61043 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NinQ61043 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NinQ61043 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NinQ61043 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NinQ61043 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NinQ61043 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms