Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms