Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis1Q60954 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms