Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik1Q60934 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik1Q60934 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms