Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stxbp3Q60770 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp3Q60770 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms