Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf3Q60765 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms