Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxd4Q60688 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms