Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema5bQ60519 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema5bQ60519 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema5bQ60519 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms