Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms