Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms