Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NacadQ5SWP3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NacadQ5SWP3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms