Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynrgQ5SV85 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynrgQ5SV85 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms