Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm27Q5SFM8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbm27Q5SFM8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm27Q5SFM8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms