Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss11eQ5S248 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss11eQ5S248 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms