Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms