Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms