Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5431Q5NCB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5431Q5NCB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms