Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms