Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CoblQ5NBX1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms