Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp28Q5I043 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp28Q5I043 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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