Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms