Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eme2Q56A04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eme2Q56A04 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms