Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prune2Q52KR3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms