Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pydc3Q3V3Q4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pydc3Q3V3Q4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms