Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3E1

Ubash3a, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3aQ3V3E1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ubash3aQ3V3E1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms