Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cfap65Q3V0B4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cfap65Q3V0B4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms