Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0A6

Gm5592, Uncharacterized protein C2orf78 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5592Q3V0A6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5592Q3V0A6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5592Q3V0A6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms