Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnpc3Q3UZ01 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms