Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc114Q3UX62 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms