Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb2Q3UUV9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb2Q3UUV9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms